Transcriptômica

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Vá Além dos Dogmas

O princípio central da biologia molecular, de Francis Crick em 1958, diz que o DNA serve como molde para a síntese de RNA, que por sua vez, orienta a produção de proteínas. Nas últimas décadas muito foi detalhado sobre os papéis cruciais do RNA mensageiro, de transferência e ribossômico no processo de síntese proteica. No entanto, também foi descoberto que o RNA não se limita apenas à construção de proteínas; ele desempenha uma variedade de funções celulares, algumas das quais tradicionalmente atribuídas ao DNA e às proteínas. Muitos pesquisadores já contam com a GenOne para compreender como o RNA pode transportar informações genéticas, agir como catalisador de reações bioquímicas e modular a produção de proteínas através de estudos de sequenciamento de RNA. Explore também como os avanços do sequenciamento de nova geração vem impulsionando a transcriptômica, contribuindo para diagnósticos, tratamentos de doenças e desenvolvimento de novos produtos.

mRNA-seq

Estudo do RNA mensageiro através do preparo de bibliotecas de captura poli-A e sequenciamento em plataforma Illumina. Útil para determinar o perfil de expressão gênica, genes diferencialmente expressos e vias funcionais envolvidas em um dado fenômeno biológico.

Plataforma: Illumina PE150
Leitura Recomendada: 20M-40M reads
Bibliotecas: simples, direcional, depleção rRNA e depleção de Globinas.

lncRNA-seq

Análise focada em RNAs longos não codificadores (lncRNAs) realizada através do sequenciamento de bibliotecas direcionais depletadas de rRNA em plataforma Illumina, onde é possível entender seu papel na regulação gênica e em processos biológicos.

Plataforma: Illumina PE150
Leitura Recomendada: 30-50M reads

smallRNA-seq

Identificação e quantificação de pequenos RNA (sRNAs), como miRNAs, siRNAs e piRNAs, via preparo de biblioteca com seleção de tamanho e sequenciamento Illumina SE50, utilizado para oferecer insights sobre regulação gênica e respostas a estímulos.

Plataforma: Illumina SE50
Leitura Recomendada: 10-20M reads

circRNA-seq

Sequenciamento para identificar e quantificar RNA circulares (circRNAs), revelando sua influência na regulação pós-transcricional e na expressão gênica. Preparamos as bibliotecas com depleção de rRNA, permitindo analisar não somente circRNAs, mas também lncRNAs, mRNAs e a rede de RNAs endógenos competitivos (ceRNA).

Plataforma: Illumina PE150
Leitura Recomendada: 50-70M reads

RNA-seq Total

Sequenciamento completo de todo o RNA presente, incluindo mRNA, lncRNA e circRNA, com bioinfrmática abrangente para uma visão global da expressão gênica e regulação transcriptômica. Abordagem via depleção de rRNA seguida de preparação de biblioteca PE150 e seleção de tamanho seguida de preparação de biblioteca SE50.

Plataforma: Illumina PE150 rRNA depleted
Leitura Recomendada: 60M reads
Plataforma: Illumina SE50
Leitura Recomendada: 10-20M reads

RNA-seq Procariótico

Análise focada em mRNA procariótico via sequenciamento de bibliotecas direcionais depletadas de rRNA em plataforma Illumina. Análise bioinformática completa do transcriptoma, incluindo expressão gênica, DEGs, estrutura do transcrito e sRNAs, através do alinhamento a um genoma de referência.

Plataforma: Illumina PE150 rRNA depleted
Leitura Recomendada: 10M reads

Parâmetros de Amostras

Ácidos Nucleicos Purificados

Concentração e Pureza

 

Integridade

Qubit Conc.

(ng/μL)

Quantidade (μg) OD260/280

OD260/230

≥100

≥ 0,75 1,7-2,5

0,5-2,5

Para plantas: RIN≥7,0;

Para animais: RIN≥7,5;

5,0≥28S/18S≥1,0;

Bioinformática abrangente e ágil, podendo combinar dados de múltiplas técnicas.

ENTREGA PADRÃO

Os resultados são entregues sempre com relatórios de controle de qualidade via compartilhamento em nuvem, com backup garantido por pelo menos 90 dias.

Distribuição Gnômica

Alinahmento com Genoma de Referência

Expressão Gênica

Explore Genes Diferencialmente Expressos

Avaliação Estrutural

Estudo de Splicing Alternativos e Novos Transcritos

Estudo Funcional

Análise de Vias Metabólicas e de Sinalização

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